石墨冷凝器使用時間長，石墨管會損壞。此時，應及時檢查是否有泄漏。如有泄漏，應及時更換。小編認為，一般的檢查方法是先對管根進行壓力試驗，看哪根管道有泄漏，但檢查泄漏效率太低。例如，檢查石墨冷凝器的管道需要五分鐘，因此檢查設備需要近兩天的時間。

管殼式石墨冷凝器可在管段內進行水處理。當水面在50mm到100mm之間時，可以打開排氣管上的閥門，將漏入石墨冷凝器殼程的水排出。此時需要注意的是，設備中的石墨管很容易找到。如果水面上有渦流，用塞子盡快塞緊。同時，關閉石墨冷凝器排氣管的閥門，一遍又一遍地重復。